Tramite l'utilizzo dei computer la ricerca scientifica ha raggiunto risultati impensabili fino a pochi anni fa. La potenza di calcolo consente ai ricercatori di raccogliere e elaborare quantità enormi di dati e contemporaneamente di conservare e mettere a disposizione degli altri ricercatori i risultati di tali ricerche: quantità enormi di nuovi dati.
I personal computer però, che pure sono ormai diffusi e utilizzati in tutti gli ambiti, spesso non sono sufficienti per affrontare le ricerche più complesse, servono risorse più potenti, e competenze di altissimo livello per poterli utilizzare al meglio.
Fin dal 1969, il Cineca affronta le problematiche connesse all'utilizzo dei supercalcolatori per il Calcolo scientifico, e nel corso degli anni ha sempre saputo accompagnare e spesso anticipare le esigenze dei ricercatori.
Per la ricerca scientifica e tecnologica il Consorzio mette a disposizione una struttura di calcolo ai più alti livelli in Europa e nel mondo, le sue risorse sono le più potenti in Italia. Ma la potenza di calcolo da sola non è sufficiente: il personale del Consorzio abbina alla formazione scientifica le competenze informatiche, e accompagna o indirizza i ricercatori nel loro lavoro, identificando con loro gli strumenti più adatti a condurre le loro ricerche e a ottenere i massimi risultati.
Fin dagli anni Ottanta, poi, il Cineca ha acquisito competenze all'avanguardia nell'ambito della Visualizzazione scientifica, ulteriore strumento a supporto della ricerca. La Visualizzazione consente ai ricercatori di rendere per immagini i risultati delle proprie ricerche, o di manipolarli. Il Teatro virtuale del Cineca consente una visualizzazione immersiva, e gli strumenti a disposizione del Laboratorio VisIT consentono l'interazione con i dati.
Il Consorzio ha saputo imporsi anche a livello internazionale, partecipando a diversi progetti della Comunità Europea come partner di importanti centri di ricerca, e in alcuni casi anche come coordinatore.
Le discipline che beneficiano del Calcolo ad alte prestazioni grazie al supporto del Cineca sono tutte le discipline scientifiche, dalle più classiche (Fisica, Chimica, Astronomia...) alle più nuove (Beni culturali, Territorio, Biomedicina...).